傳統(tǒng)觀點認為，清淤是解決底泥問題的唯一途徑。針對5年以上未治理的河道、湖泊，清淤是消除底泥的最佳選擇；而針對僅有幾年的河道、湖泊，可采用底泥原位修復技術(shù)進行治理。目前常用的底泥原位修復技術(shù)有投撒化學藥劑、種植水生植物、曝氣充氧、微生物凈化等。

投撒化學藥劑的目的一般有兩個：一個是抑制底泥污染物釋放，如硝酸鈣、聚合氯化鋁等，時效后很快會造成污染物更大強度釋放；另一個則是加速底泥污染物釋放，如過氧化鈣、過碳酸鈉等，通過為底泥增氧，快速分解污染物。投撒化學藥劑存在時效性短、治標不治本，無法真正消除底泥污染物。

水生植物則是通過植物生長過程中吸收底泥中的部分營養(yǎng)成分，消除底泥污染物，但僅局限于水生植物自身生長所需物質(zhì)，底泥中大部分的有機有害物質(zhì)無法通過水生植物去除。另外，水生植物腐爛凋落物也會成為新的污染物。

曝氣充氧的作用，也是加速底泥污染物釋放，通過底泥增氧，使好氧污染物快速釋放，一般通過微生物凈化，最終實現(xiàn)底泥污染物消除。HDP直接凈化工藝中的底泥原位修復技術(shù)，就是借助曝氣充氧+微生物凈化，直接將底泥中的有機污染物氧化分解，變成無污染的無機物，從而把不斷釋放污染物的黑臭底泥變成了對水體無害的物質(zhì)。